Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PUDPQ08623 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PUDPQ08623 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms