Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
CHRNDQ07001 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CHRNDQ07001 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms