Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
PAX8Q06710 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms