Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LTBQ06643 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms