Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GABPAQ06546 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GABPAQ06546 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms