Protein–RNA interactions for Protein: Q04721

NOTCH2, Neurogenic locus notch homolog protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTCH2Q04721 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NOTCH2Q04721 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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NOTCH2Q04721 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
NOTCH2Q04721 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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