Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ATP7AQ04656 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.3 ms