Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
RELAQ04206 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
RELAQ04206 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELAQ04206 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELAQ04206 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELAQ04206 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELAQ04206 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELAQ04206 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.02■□□□□ 0.31
RELAQ04206 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
RELAQ04206 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms