Protein–RNA interactions for Protein: Q03181

PPARD, Peroxisome proliferator-activated receptor delta, humanhuman

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARDQ03181 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PPARDQ03181 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms