Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CREMQ03060 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CREMQ03060 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms