Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
XPCQ01831 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XPCQ01831 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
XPCQ01831 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
XPCQ01831 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
XPCQ01831 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms