Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
E2F1Q01094 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms