Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 MACROD2-AS1-202ENST00000455291 663 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SPTBN1Q01082 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms