Protein–RNA interactions for Protein: Q00872

MYBPC1, Myosin-binding protein C, slow-type, humanhuman

Predictions only

Length 1,141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYBPC1Q00872 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
MYBPC1Q00872 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MYBPC1Q00872 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms