Protein–RNA interactions for Protein: P80075

CCL8, C-C motif chemokine 8, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL8P80075 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL8P80075 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CCL8P80075 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CCL8P80075 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
CCL8P80075 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms