Protein–RNA interactions for Protein: P78504

JAG1, Protein jagged-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAG1P78504 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
JAG1P78504 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
JAG1P78504 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
JAG1P78504 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms