Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ACTG1P63261 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms