Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 DISP3-201ENST00000294484 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
HERVK_113P61574 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
HERVK_113P61574 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.9 ms