Protein–RNA interactions for Protein: P60880

SNAP25, Synaptosomal-associated protein 25, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25P60880 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SNAP25P60880 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms