Protein–RNA interactions for Protein: P60608

ERVFC1-1, Endogenous retrovirus group FC1 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1-1P60608 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ERVFC1-1P60608 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
ERVFC1-1P60608 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms