Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
EPHB3P54753 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms