Protein–RNA interactions for Protein: P52209

PGD, 6-phosphogluconate dehydrogenase, decarboxylating, humanhuman

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGDP52209 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
PGDP52209 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
PGDP52209 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PGDP52209 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms