Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NUP153P49790 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NUP153P49790 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NUP153P49790 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NUP153P49790 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NUP153P49790 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms