Protein–RNA interactions for Protein: P48751

SLC4A3, Anion exchange protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A3P48751 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
SLC4A3P48751 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SLC4A3P48751 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms