Protein–RNA interactions for Protein: P48681

NES, Nestin, humanhuman

Predictions only

Length 1,621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NESP48681 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
NESP48681 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
NESP48681 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
NESP48681 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
NESP48681 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NESP48681 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
NESP48681 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
NESP48681 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.36
NESP48681 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NESP48681 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NESP48681 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
NESP48681 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NESP48681 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NESP48681 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
NESP48681 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
NESP48681 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
NESP48681 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
NESP48681 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms