Protein–RNA interactions for Protein: P48067

SLC6A9, Sodium- and chloride-dependent glycine transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A9P48067 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SLC6A9P48067 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms