Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
UTRNP46939 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
UTRNP46939 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
UTRNP46939 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
UTRNP46939 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
UTRNP46939 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms