Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NR4A2P43354 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms