Protein–RNA interactions for Protein: P40818

USP8, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP8P40818 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP8P40818 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP8P40818 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP8P40818 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP8P40818 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP8P40818 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP8P40818 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP8P40818 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP8P40818 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
USP8P40818 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
USP8P40818 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
USP8P40818 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
USP8P40818 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms