Protein–RNA interactions for Protein: P35916

FLT4, Vascular endothelial growth factor receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT4P35916 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FLT4P35916 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
FLT4P35916 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
FLT4P35916 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLT4P35916 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLT4P35916 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLT4P35916 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLT4P35916 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLT4P35916 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLT4P35916 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLT4P35916 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLT4P35916 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
FLT4P35916 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLT4P35916 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLT4P35916 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FLT4P35916 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
FLT4P35916 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLT4P35916 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLT4P35916 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
FLT4P35916 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms