Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
GJA4P35212 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
GJA4P35212 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
GJA4P35212 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms