Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP1P29466 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP1P29466 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP1P29466 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP1P29466 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP1P29466 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP1P29466 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP1P29466 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CASP1P29466 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP1P29466 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP1P29466 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP1P29466 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP1P29466 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP1P29466 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP1P29466 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP1P29466 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
CASP1P29466 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
CASP1P29466 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
CASP1P29466 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms