Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HLA-DMAP28067 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HLA-DMAP28067 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.9 ms