Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,997 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
PTPRBP23467 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms