Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CCL1P22362 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CCL1P22362 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL1P22362 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCL1P22362 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL1P22362 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
CCL1P22362 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
CCL1P22362 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
CCL1P22362 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
CCL1P22362 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms