Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
POLR2CP19387 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms