Protein–RNA interactions for Protein: P16871

IL7R, Interleukin-7 receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL7RP16871 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
IL7RP16871 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
IL7RP16871 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
IL7RP16871 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms