Protein–RNA interactions for Protein: P12035

KRT3, Keratin, type II cytoskeletal 3, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT3P12035 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
KRT3P12035 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
KRT3P12035 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT3P12035 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT3P12035 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT3P12035 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT3P12035 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT3P12035 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT3P12035 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT3P12035 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT3P12035 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT3P12035 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
KRT3P12035 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms