Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
ITGAMP11215 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms