Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC006213.4-201ENST00000616184 634 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
VSIG8P0DPA2 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms