Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACAA1P09110 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ACAA1P09110 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACAA1P09110 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACAA1P09110 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACAA1P09110 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACAA1P09110 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACAA1P09110 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACAA1P09110 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACAA1P09110 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ACAA1P09110 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACAA1P09110 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACAA1P09110 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACAA1P09110 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms