Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NGFRP08138 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms