Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NEFMP07197 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NEFMP07197 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NEFMP07197 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NEFMP07197 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NEFMP07197 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms