Protein–RNA interactions for Protein: O75909

CCNK, Cyclin-K, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNKO75909 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CCNKO75909 PAPOLA-223ENST00000557320 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCNKO75909 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNKO75909 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNKO75909 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNKO75909 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNKO75909 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNKO75909 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCNKO75909 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCNKO75909 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCNKO75909 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms