Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CTNSO60931 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms