Protein–RNA interactions for Protein: O60486

PLXNC1, Plexin-C1, humanhuman

Predictions only

Length 1,568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNC1O60486 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PLXNC1O60486 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms