Protein–RNA interactions for Protein: O60264

SMARCA5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA5O60264 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SMARCA5O60264 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms