Protein–RNA interactions for Protein: O43482

OIP5, Protein Mis18-beta, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OIP5O43482 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OIP5O43482 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OIP5O43482 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OIP5O43482 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OIP5O43482 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OIP5O43482 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OIP5O43482 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OIP5O43482 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OIP5O43482 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
OIP5O43482 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
OIP5O43482 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
OIP5O43482 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
OIP5O43482 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.2 ms