Protein–RNA interactions for Protein: O15205

UBD, Ubiquitin D, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBDO15205 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBDO15205 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
UBDO15205 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
UBDO15205 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms