Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD28O15084 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms